Haruyuki Arita es un estudiante de secundaria con sobrepeso y acosado que encuentra consuelo en los juegos en línea. Pero su vida da un giro drástico un día, cuando descubre que todos sus puntajes altos han sido superados por Kuroyukihime, el popular vicepresidente del consejo estudiantil. Luego lo invita a la sala de estudiantes y le presenta "Brain Burst", un programa que permite a los usuarios acelerar sus ondas cerebrales hasta el punto en que el tiempo parece detenerse. Brain Burst también funciona como un juego de lucha de realidad aumentada, y para obtener más puntos para acelerar, los usuarios deben ganar duelos contra otros jugadores. Sin embargo, si un usuario pierde todos sus puntos, también perderá el acceso a Brain Burst para siempre. Kuroyukihime explica que eligió mostrarle el programa a Haruyuki porque necesita su ayuda. Quiere conocer al creador de Brain Burst y descubrir la razón por la que se creó, pero es más fácil decirlo que hacerlo; para hacerlo, debe derrotar a los "Seis Reyes de Color Puro", poderosos líderes de facciones dentro del juego, y alcanzar el nivel 10, el nivel más alto posible. Después de que la niña ayuda a Haruyuki a superar a los matones que lo atormentan, él promete ayudarla a alcanzar su objetivo, y así comienza la lucha del dúo para llegar a la cima.