Algo bonito para purificar tu alma, puerko-cun... La estudiante promedio de secundaria, Yuuko Konagai, tiende a ser bastante tímido y socialmente incómodo. Debido a esto, además de sacar notas bastante mediocres, apenas tiene amigos dentro de su clase. Sin embargo, después de un día monótono en la escuela, regresa a su tan esperado refugio: ¡casa con sus gatos Maa, Shi y Ro! Con sus personalidades únicas, los tres poseen cuerpos similares a los de los humanos, conservando la capacidad de hablar y comunicarse. Todos los días, el adorable grupo espera el regreso de su dueña para brindarle la compañía que tanto necesita. Nyanko Days destaca la vida de Yuuko y sus gatos mientras alegran cada momento y hacen nuevos amigos en los días que pasan.