En un día tranquilo y pacífico, los cielos se abren y seres extradimensionales, designados como los Desconocidos, lanzan un ataque rápido y brutal contra la humanidad. Para proteger el futuro del país, todos los niños de Japón son congelados criogénicamente hasta el final de la guerra para mantenerlos fuera de peligro. Pasan varios años y la humanidad ha establecido un punto de apoyo en un rincón de Japón, que ahora sirve como primera línea de guerra. Ya sin enfrentarse a la extinción de la humanidad, los niños se despiertan de su sueño. Luego se descubre que, mientras estaban en criogénesis, los niños habían desarrollado mundos, poderes sobrenaturales únicos para cada persona. Los seis niños más poderosos reciben el mando de las ciudades recuperadas y usan sus poderes para defender las fortalezas contra la continua invasión. Los amigos de la infancia Ichiya Suzaku y Canaria Utara dirigen Tokio, los hermanos Kasumi y Asuha Chigusa gestionan Chiba, y Maihime Tenkawa y Hotaru Rindou supervisan Kanagawa. Con el tiempo, los ataques casi rutinarios de lo Desconocido y las personalidades enfrentadas de los jefes y subjefes de la ciudad cultivan pequeñas rivalidades, lo que lleva a discusiones constantes entre las tres ciudades. Con lo Desconocido aumentando repentinamente la presión de sus ataques, los líderes de las tres ciudades deben aprender a trabajar juntos o arriesgarse a perder la última línea de defensa contra la extinción de la humanidad.